TOP2 and YY1 occupancy predict promoter proximal pausing genome wide

Martínez García, Pedro Manuel; Cortés Ledesma, Felipe

Publication:
TOP2 and YY1 occupancy predict promoter proximal pausing genome wide

dc.contributor.author	Martínez García, Pedro Manuel
dc.contributor.author	Cortés Ledesma, Felipe
dc.date.accessioned	2026-01-12T07:23:15Z
dc.date.available	2026-01-12T07:23:15Z
dc.date.issued	2018-10-09
dc.description.abstract	En este trabajo, evaluamos la capacidad de diversos factores genéticos y epigenéticos para predecir la pausa proximal del promotor (PPP), un proceso fundamental en la regulación de la expresión génica en eucariotas superiores. A través de nuestro análisis, identificamos que la ADN Topoisomerasa II (TOP2) y la proteína estructural YY1 presentan el mayor poder predictivo positivo del estado de pausa en los promotores. Asimismo, demostramos que la proteína CTCF actúa como un predictor negativo de la pausa, sugiriendo que su asociación con este proceso propuesta en la literatura se debe a su co-localización con TOP2B y YY1. Nuestro estudio sugiere que tanto la topología del ADN como los bucles potenciador-promotor mediados por YY1 son elementos clave en el control de la PPP.
dc.description.sponsorship	Centro Andaluz de Biología Molecular y Medicina Regenerativa
dc.format.mimetype	application/pdf
dc.identifier.uri	https://hdl.handle.net/10433/25443
dc.language.iso	en
dc.publisher	No aplica
dc.relation.projectID	info:eu-repo/grantAgreement/AEI/Plan Estatal de Investigación Científica y Técnica y de Innovación 2013-2016/SAF2017-89619-R/ES/PAPEL DE LA TOPOISOMERASA II EN LA ORGANIZACION, EXPRESION Y ESTABILIDAD DEL GENOMA: IMPLICACIONES PATOLOGICAS Y OPORTUNIDADES TERAPEUTICAS/
dc.relation.projectID	info:eu-repo/grantAgreement/ERC/ERC_consolidator/TOPOmics-647359//Global Dymamics of TopoisomeraseInduced DNA Breaks//TOPOmics-647359
dc.rights	Attribution-NonCommercial-NoDerivatives 4.0 International	en
dc.rights.accessRights	open access
dc.rights.uri	http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/
dc.subject	Promoter proximal pausing
dc.subject	TOP2B
dc.subject	YY1
dc.subject	CTCF
dc.title	TOP2 and YY1 occupancy predict promoter proximal pausing genome wide
dc.type	conference output
dc.type.hasVersion	NA
dspace.entity.type	Publication
relation.isAuthorOfPublication	066f0a79-1caa-4d35-a44d-87e3d3f6e407
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