Publication:
TOP2 and YY1 occupancy predict promoter proximal pausing genome wide

Thumbnail Image

Files

EMBO_2018_PMMG.pdf (643.57 KB)

Identifiers

URI: https://hdl.handle.net/10433/25443

Publication date

2018-10-09

Reading date

Event date

Start date of the public exhibition period

End date of the public exhibition period

Authors

Cortés Ledesma, Felipe

Advisors

Authors of photography

Person who provides the photography

Journal Title

Journal ISSN

Volume Title

Publisher

No aplica
Export

Research Projects

Organizational Units

Journal Issue

Abstract

En este trabajo, evaluamos la capacidad de diversos factores genéticos y epigenéticos para predecir la pausa proximal del promotor (PPP), un proceso fundamental en la regulación de la expresión génica en eucariotas superiores. A través de nuestro análisis, identificamos que la ADN Topoisomerasa II (TOP2) y la proteína estructural YY1 presentan el mayor poder predictivo positivo del estado de pausa en los promotores. Asimismo, demostramos que la proteína CTCF actúa como un predictor negativo de la pausa, sugiriendo que su asociación con este proceso propuesta en la literatura se debe a su co-localización con TOP2B y YY1. Nuestro estudio sugiere que tanto la topología del ADN como los bucles potenciador-promotor mediados por YY1 son elementos clave en el control de la PPP.

Doctoral program

Related publication

Research projects

info:eu-repo/grantAgreement/AEI/Plan Estatal de Investigación Científica y Técnica y de Innovación 2013-2016/SAF2017-89619-R/ES/PAPEL DE LA TOPOISOMERASA II EN LA ORGANIZACION, EXPRESION Y ESTABILIDAD DEL GENOMA: IMPLICACIONES PATOLOGICAS Y OPORTUNIDADES TERAPEUTICAS/
info:eu-repo/grantAgreement/ERC/ERC_consolidator/TOPOmics-647359//Global Dymamics of TopoisomeraseInduced DNA Breaks//TOPOmics-647359

Description

Keywords

Promoter proximal pausing
TOP2B
YY1
CTCF

Bibliographic reference

Photography rights

Collections

DDI - Comunicaciones de congresos