RT Conference Proceedings
T1 Analysis of Relevance and Redundance on Topoisomerase 2b (TOP2B) Binding Sites: A Feature Selection Approach
A1 Martínez García, Pedro Manuel
A1 García Torres, Miguel
A1 Divina, Federico
A1 Gómez-Vela, Francisco Antonio
A1 Felipe Cortés-Ledesma, 
K1 TOP2B
K1 Machine learning
K1 Feature selection
K1 Chromatin arquitecture
AB En este estudio empleamos técnicas de aprendizaje automático y selección de atributos para identificar elementos genómicos que determinan la unión de la proteína Topoisomerasa 2b (TOP2B) al genoma. En concreto, hacemos uso de datos de accesibilidad del ADN, arquitectura de la cromatina, marcas epigenéticas, expresión, entre otros. Nuestros modelos predicen los sitios de unión de TOP2B con un 94% de precisión basándose exclusivamente en tres elementos: la accesibilidad del ADN (DNase-seq) y la presencia de proteínas del complejo de cohesina (RAD21 y STAG2). Estos resultados sugieren que la localización de la TOP2B está definida principalmente por la estructura tridimensional y la apertura de la cromatina en las anclas de los bucles de ADN.
PB Springer Nature
YR 2018
FD 2018-03-08
LK https://hdl.handle.net/10433/25344
UL https://hdl.handle.net/10433/25344
LA en
NO Lecture Notes in Computer Science ,volume 10784. EvoApplications 2018: Applications of Evolutionary Computation, 86-101
NO CABIMER
DS RIO
RD May 8, 2026