RT Journal Article
T1 T346Hunter: A Novel Web-Based Tool for the Prediction of Type III, Type IV and Type VI Secretion Systems in Bacterial Genomes
A1 Martínez García, Pedro Manuel
A1 Ramos, Cayo
A1 Rodríguez Palenzuela, Pablo
K1 T3SS
K1 T4SS
K1 T6SS
K1 Bacterial genomes
K1 Prediction
AB En este trabajo presentamos T346Hunter, una herramienta web diseñada para la identificación y localización automatizada de sistemas de secreción tipo III, IV y VI (T3SS, T4SS y T6SS) en genomas bacterianos. Mediante el uso de modelos ocultos de Márkov (HMM) y una base de datos exhaustiva de componentes estructurales, nuestro servidor permite analizar tanto genomas completos como borradores, así como visualizar los clústeres genómicos de forma gráfica e intuitiva. También validamos la eficacia de la herramienta comparando nuestras predicciones con las de otros repositorios especializados. Con esta herramienta, buscamos facilitar a la comunidad científica la identificación de sistemas de secreción en genomas bacterianos de interés, lo que puede resultar de gran ayuda de cara al desarrollo de estrategias de control contra enfermedades bacterianas mediadas por efectores.
PB PLOS
YR 2015
FD 2015-04-13
LK https://hdl.handle.net/10433/26139
UL https://hdl.handle.net/10433/26139
LA en
NO PLoS One . 2015 Apr 13;10(4):e0119317
NO Universidad Politécnica de Madrid
NO Universidad de Málaga
DS RIO
RD May 8, 2026