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Genome wide association of TOP2B and CTCF binding with promoter- proximal transcriptional pausing

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URI: https://hdl.handle.net/10433/25350

Publication date

2017-09-17

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Authors

Gómez Marín, Carlos
Herrero Ruiz, Andrés
Jimeno González, Silvia
Cortés-Ledesma, Felipe

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Abstract

Este estudio investiga cómo la interacción entre la topoisomerasa TOP2B y el factor de arquitectura cromosómica CTCF regula la pausa de la ARN polimerasa II en los promotores génicos. Analizando datos de secuenciación masiva mediante métodos de aprendizaje automático supervisado, nuestro trabajo sugiere que la acción conjunta de la topología del ADN y la organización de la cromatina controla la transición hacia una elongación transcripcional productiva.

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info:eu-repo/grantAgreement/ERC/ERC_consolidator/TOPOmics-647359//Global Dymamics of TopoisomeraseInduced DNA Breaks

Description

Keywords

TOP2B
CTCF
Transcriptional pausing
Machine learning

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